安徽中医药大学第二附属医院（安徽省针灸医院、安徽中医药大学第二临床医学院）创建于1985年，是全国最早成立、目前也是全国规模最大的集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的三级甲等针灸专科医院，是国家中医药管理局“中医药国际合作基地”、世界针灸学会联合会“临床基地”、国家中医药管理局“中医药标准化研究推广基地”、中国针灸学会“针灸标准化研究示范基地”、安徽省针灸临床国际联合研究中心，安徽省特色中医院，内设安徽省中医药科学院针灸临床研究所。

医院占地面积18790平方米，建筑面积51500平方米，设有28个临床科室，开放病区25个，医技科室9个，核定床位810张。医院现有在岗职工915人，高级职称131人。拥有全国名老中医学术经验继承导师6人，名老中医学术经验继承人32人，全国中医药优秀临床人才3人；博士生导师8人，硕士生导师55人；全国名中医1人，江淮名医14人，安徽省国医名师3人，安徽省名中医16人，省政府津贴1人，省学术技术带头人1人、后备人选2人，全国中医优秀临床人才7人，全国中药特色技术人才3人，全国中医药创新骨干人才、西学中骨干人才、中医临床技术特色骨干共计5人，安徽省中医药领军人才4人；国家级临床重点专科带头人3人，国家局“十三五”重点专科带头人8人，省级临床重点专科带头人10人，省级临床重点专病带头人3人。

医院设有脑病、骨伤、推拿、脾胃、老年病、康复、心内、内分泌、呼吸、肿瘤、皮肤、肛肠、妇、男、儿、外、五官、眼、口腔、急诊、麻醉、重症等临床科室及治未病中心。拥有国家重点学科2个，国家临床重点专科3个，国家中管局重点专科8个，安徽省中医药管理局重点专科7个、重点专病3个，国家名中医工作室4个，省名中医工作室13个。医院拥有核磁共振成像系统、多层螺旋CT、全自动生化分析仪等先进大型医疗仪器设备16台。拥有中医体质辨识系统、中药煎药包装机、中药制剂设备、中医推拿康复理疗设备等大型仪器。

“十三五”期间，医院承担各级各类科研项目共218项，其中国家级项目4项，安徽省自然基金、安徽省中央引导地方科技发展专项等省部级项目53项、厅局级项目156项，横向合作项目10项。获省部级以上科技奖励15项，国家发明专利3项，实用新型专利13项。开展医院历代名老中医学术经验的整理和挖掘，发表论文130篇，形成专著3项。国家中医医疗服务标准化试点建设项目、中医药研究伦理审查体系（CAP）认证分别通过中期评估和现场审核。获批建设安徽省针灸临床医学研究中心，安徽省针灸临床国际联合研究中心在2020年度绩效评价中获得优秀等次。针药结合防治脑病产业创新团队入选安徽省第十三批“115”产业创新团队。

医院连续多年荣获“安徽中医药大学先进集体”、“合肥市文明单位”等荣誉称号，2017年8月荣获“全国卫生计生系统先进集体”称号。2019年3月荣获国家卫生健康委财务司2017-2018年；2021年荣获2020年全国医疗服务价格和成本监测与研究网络“先进机构”称号。2020年获“中国抗疫医疗专家组组派工作表现突出单位”荣誉。