医院始建于1888年，前身为“中华基督教礼贤会东莞普济医院”，是我国最早建立的西医院之一，也是我国第一家德国教会医院。经过130多年的积淀，现已发展成为集医疗、教学、科研及预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院。2020年12月29日，东莞市人民政府与南方医科大学签订合作共建协议，医院成为南方医科大学附属东莞医院。2021年3月，医院入选广东省高水平医院重点建设医院。

医院总占地面积35.73万平方米，建筑面积32.57万平方米，下辖红楼院区、普济院区2个院区，中心门诊部、第一门诊部、第二门诊部3个门诊部，定编床位3100张，实际开放床位3020张，并先后与谢岗医院、石碣医院、市康复医院、黄江医院、望牛墩医院等建立医疗联合体。年门、急诊量近360万人次，出院人次12.4万，住院手术6.3万例次。在岗员工4527人，其中，正高职称211人、副高职称505人，博士53人（其中博士后12人）、硕士452人，享受“国务院政府特殊津贴”专家2名，广东省名中医3名、广东省杰出青年医学人才3名，东莞市特色人才6名、东莞市名医58名，东莞市医学领军人才8名，东莞市医学学科带头人35名，东莞市杰出青年医学人才18名，东莞市医学学科骨干213人。

医院专业分工细，覆盖病种齐全，设有43个临床科室，10个医技科室，拥有呼吸内科、神经内科、内分泌科、肾内科、神经外科、胸外科、眼科、烧伤整形科、肿瘤科、病理科、临床护理等11个广东省临床重点专科，1个省“十一五”医学特色专科（肿瘤科），中西医结合肿瘤科、中医护理、中医临床药学等3个省“十三五”中医药重点专科建设项目，消化内科、心血管内科、普外科、乳腺科、麻醉科、泌尿外科、骨外科、口腔科、心脏大血管外科、产科、妇科、新生儿科、重症医学科、超声医学科、医学影像科、老年护理、手术室护理、重症护理等32个市临床重点专科。拥有1个国家级青年文明号（冠心病重症监护室），3个省级青年文明号，5个市级青年文明号。国家胸痛中心、国家房颤中心、国家高级卒中中心、国家药物临床试验机构、Ⅰ期临床试验中心、国家标准化代谢性疾病管理中心、广东省肿瘤诊疗建设示范单位、广东省胸痛中心示范基地，以及多个国家级、省级、市级培训基地、质量控制中心先后落户我院。正加快推进硼中子俘获治疗（BNCT）项目建设。

医院技术力量雄厚，注重发展高新技术，先后开展了造血干细胞移植技术、同种异体皮肤移植技术、放射性粒子植入技术、肿瘤消融治疗技术、肿瘤深部热疗和全身热疗技术等多项国家级限制类技术，以及心血管病介入治疗技术、神经血管介入诊疗技术、髋、膝关节置换术等多项广东省限制类技术。在微创、介入等多个医疗技术领域居省内先进水平，腔镜技术已向减孔、单孔、自然腔道等方向发展。开展复杂动脉夹层及腹主动脉瘤介入治疗、微创腔镜下心脏瓣膜置换手术、瓣膜矫形术、慢性闭塞病变逆向技术开通、IVUS指导下左主干分叉病变的介入治疗、IVUS 指导下肾功能衰竭患者微量造影剂支架植入、神经导航辅助下颅脑病变手术、神经内镜下颅脑病变手术、颅内复杂血管病变介入治疗、脊柱肿瘤EN-BLOC（全脊椎切除）技术、全脊柱椎间孔镜技术、显微镜下脊柱肿瘤切除手术、输尿管软镜钬激光碎石术、腹腔镜胃癌根治术、结直肠肿瘤经自然腔道取出标本手术的应用、内镜经粘膜下隧道肿瘤切除术、腹腔镜辅助中低位直肠癌经肛全系膜切除术等多项高新技术。

医院拥有一大批先进的医疗设备，总价值12.56亿元。包括PET/CT、SPECT/CT、3.0T磁共振、256层CT、全数字化血管减影（DSA）系统、实时四维图像引导直线加速器系统、多层螺旋CT模拟定位机、高剂量率后装机、口腔全景DR机、数字化乳腺X光机、实时四维彩色超声波诊断仪、经食道心脏四维超声系统、3D电子腹腔镜、荧光腹腔镜、手术显微镜、基因分析仪、全自动微生物质谱检测系统、全高清宫腔镜系统、超声支气管镜系统、超声电子消化内镜系统、超声外科吸引系统、体外循环机系统、骨科三维C臂、移动式C形臂X射线系统（ERCP）、移动G臂、脊柱微创手术系统、鼻窦镜系统、小儿支气管镜、医用钬激光系统、双波长激光治疗机、神经肌肉刺激治疗仪、二氧化碳激光治疗系统、光学相关断层扫描仪、美国AMO眼科准分子激光手术治疗系统、肺功能测试系统、超声眼科晶状体摘除和玻璃体切除设备及附件、内镜电外科工作站、移动CT、体外生命支持系统（ECMO）、主动脉内球囊反搏泵、方舱CT等，显著提升了医院整体医疗技术水平和急危重症处置能力，保障了临床诊断及治疗工作顺利开展。

医院坚持走科教兴院、医教相长之路，是南方医科大学、暨南大学、广东医科大学医学研究生培养点，是广东医科大学东莞临床医学院、国家首批住院医师规范化培训基地。承担着中山大学、南方医科大学、广东医科大学等全国10余所高等医学院校的临床教学和实习任务。现有博士生导师2人，硕士生导师18人，兼职教授、副教授及讲师48人。医院注重科技创新，重视科研人才培养、引进和科研投入，是东莞市肿瘤临床医学研究所、东莞市呼吸和重症医学研究所、东莞市公立医院中心实验室的依托单位。近5年承担国家、省、市等各级科研课题273项，其中国家自然科学基金5项；获市级以上科技进步奖13项，发表医学论文1700余篇，其中SCI论文139篇。

医院于2012年获得国家药物临床试验机构资格认定，至今已备案药物临床试验专业11个、器械临床试验专业19个，并于2018年建成Ⅰ期临床试验中心。主持和参与Ⅰ类创新药物、国际多中心新药、仿制药生物等效性、新器械、新检测试剂等注册类临床试验项目超过100项。

医院坚持“医护同心，关爱社群”的服务宗旨，不断优化就医流程，提高工作效率，提升服务品质。1994年获国家“爱婴医院”，1995年被国家卫生部评为“三级甲等”医院，1998年被授予“广东省高等医学院校教学医院”。近年来，先后获得全国百姓放心示范医院、全国百佳优质示范品牌医院、全国综合医院中医药工作示范单位，广东省文明单位、文明医院、百家文明医院、卫生系统行业作风建设先进集体，东莞市文明示范单位、固本强基工程市级示范点、卫生工作先进单位、文化建设标兵医院、市园林单位等荣誉。医院稳居全国地级市医院竞争力榜单前列，连续7年保持全省地级市医院竞争力前三位，获“粤港澳大湾区最佳医院80强”称号。2018年3月，医院高分通过“三甲”复审，标志着医院在新医改形势下的医疗服务能力和整体水平迈上了一个新台阶。在2018年、2019年国家三级公立医院绩效考核中取得A等级。

在新的征程上，医院将秉承“自强不息，仁爱博精”的院训，以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，全面贯彻落实党的十九大精神，牢固树立以人民为中心的发展思想，以人民群众的满意度为标准，继承和发扬百年红楼精神，充分发挥在全市医疗行业的龙头作用，以建设广东省高水平医院和粤港澳大湾区区域医疗中心为目标，力争在提高医疗品质、提升科教水平、优化服务体系、建设“智慧医院”、开展社会服务和改善医院环境等方面取得新突破，奋力书写“湾区都市、品质东莞”建设的“品质医疗”优秀答卷。