黑龙江省海员总医院成立于1953年，是集预防保健、临床医疗、康复、科研、教学于一体三级康复专科公立医院，医院隶属于黑龙江省卫生健康委，为黑龙江省第六医院，是省、市医保的定点医院、黑龙江省肢体康复定点医院、“0-6岁脑瘫儿童”抢救性康复治疗定点康复机构、东三省康复治疗三级体系建设试点单位，是黑龙江省儿童康复专科联盟、医养结合为老服务专科联盟牵头单位，被黑龙江省民政厅、黑龙江省卫健委联合批准成为黑龙江省医养结合培训基地，并被国家老龄委定为全国爱心护理工程示范单位。

医院属差额补贴事业单位。现有党委成员5人，1位书记，4位委员。在岗职工533人，72%为专业技术人员，全部是正规院校毕业。各学科带头人都经过全国一流临床医院长期严格的培训和研修，并在专业技术方面有了不同程度的建树和造诣，在各自的工作岗位上作出了较出色的业绩和突出的贡献。

我院拥有CT、数字多功能X光机、高压氧舱、彩超、B超、心电综合分析仪、经颅多普勒、骨密度测定仪、乳腺超声检测仪、全自动生化分析仪、血流变检测仪、血细胞分析仪、多功能监护仪、口腔烤瓷、铸瓷、系统的康复器材等大型医疗诊治检查设备。

医院设有内科、外科、妇产科、儿科、急诊科、康复科、口腔科、中医科、五官科、临终关怀科、药剂科、检验科、放射线科、物理诊断科、麻醉科、输血科、高压氧科、体检科等医疗科室。

总院坐落于江畔路128号，江北院区于哈尔滨市呼兰区荣昌路1728号，总使用面积38405.61平方米。医院以发展康复、医养为核心品牌，多学科综合协调发展。