建宁县总医院前身是建宁县医院，始建于1937年，是建宁县唯一一所二级综合医院。2017年根据三明医改的整体部署，将县中医院、8个乡镇卫生院、1个社区卫生服务中心组建成医共体——建宁县总医院。

建宁县总医院担负着全县16万人口的医疗急救、预防保健、康复和基本公共卫生等工作任务。2017年在县委、县政府的高度重视下，投资4.65亿元，在县水南荷花变电站东侧（现为濉溪镇将军路36号）新建新院区，占地面积86.25亩，总建筑面积5.84万平方米，建有住院楼、医技楼、门急诊楼、行政后勤楼、传染病楼、精神病楼等6栋大楼。购置更新价值近1个亿大中型和常规较为先进医疗设备。全院（包含乡镇分院）共有职工数664人，其中专业技术人员613人；有高级职称73人，中级职称101人；本科学历121人。临床科室设有内科、外科、妇产科、儿科、中医科、急诊科、麻醉科、五官科、口腔科、皮肤科、痔疮科、针灸理疗科、体检科、精神卫生科等；医技科室设有CT室、核磁共振室、放射科、超声科、检验科、胃（肠）镜室、碎石科、病理室等10余个。

建宁县总医院新院区在2021年12月10日投入使用，优美的环境、优质的服务和良好的服务能力，更好地满足了全县人民群众的基本医疗健康需求。