上海市第六人民医院东院于2009年9月26日开工建设，2012年10月26日开业（试运行）。东院作为原南汇地区唯一一家三级医院，对提升南汇新城及浦东周边地区医疗服务能力，满足区域内居民卫生健康的需求，实现南汇新城新一轮发展将起着十分重要的医疗保障作用。

东院占地面积150亩，建筑面积7.2万多平方米，核定床位600张，设42个专业业务科室(其中临床科室33个、医技科室9个)， 是一所集医、教、研于一体的三级甲等综合性医院。 东院传承六院母体医院的医疗特色和百年文化，两院实行一体化管理，六院临床、医技科主任兼任东院临床医技科室主任，全面负责东院科室的医疗业务管理。 目前东院临床医师171名，其中41%具有副高以上高级职称，博导9名，硕导11名。

东院拥有先进的医疗设备，包括：核磁共振、全身CT、DSA、SPECT、乳腺DR和全自动生化分析仪等。 东院致力于打造数字化医院，配备了包括HIS、PACS、LIS、RIS、手术麻醉、临床路径管理、心电电生理、办公自动化、绩效考核等信息系统。 全面提供自助挂号、自助缴费、自助预约、自助取报告等服务，开通"一站式"服务，减少患者就诊、检验、取药、缴费等过程中的往返、排队环节，缩短就诊时间。

成立预约中心，全面实施预约服务，通过电话预约、现场预约、诊间预约、出院预约和网上预约的方式预约所有普通门诊、专家门诊和专病门诊，并且可以预约母体医院的专家门诊。