文山州中医医院始建于1985年9月，经过30多年的建设和发展，现已成为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等综合服务能力为一体的三级甲等中医医院，是云南中医药大学（非直属）附属文山中医医院、中国中医科学院广安门医院临床研究基地，以及保山中医药高等专科学校、文山州卫生学校等11所大中专院校教学基地。于2020年12月批准成为国家第三批中医住院医师规范化培训基地。

截至2020年12月共有职工663人，其中在编人员471人，合同制人员192人，返聘9人，卫生专业技术人员571人，专业技术人员中有高级职称84人，中级职称102人，麻醉医师占比4.02%，儿科医师占比3.52%，重症医师占比2.51%，病理医师占比0.50%。现有享受国务院政府特殊津贴1人，享受云南省政府特殊津贴1人，云南省“万人计划”名医专项1人，云南省第二批老中医学术经验继承导师2人、第三批老中医学术经验继承导师1人，云南省荣誉名中医1任，云南省优秀青年中医8人，云南中医药大学硕士研究生导师2人，云南省高层次中医药培训对象1人，全国西学中骨干人才1人，全国中医临床特色技术传承骨干人才1人，全国中医药创新骨干人才1人，云南省优秀医疗卫生人员2人，云南省模范优秀医师1人，文山州学术和技术带头人1人，文山州名中医2人，文山州科技技术创新人才1人，文山州“兴文人才”1人，文山州“七乡名医”培养对象7人。截至2020年，医院先后荣获省级科技进步奖三等奖1项，中国中医药研究促进会科技进步三等奖1项，州级科技进步奖51项（其中，一等奖1项，二等奖8项，三等奖40项，科普创作奖1项，科技普及奖1项），专著3部、合著5部。作为云南中医学院教学医院，承担着医学本科生、护理本科以及专科、中专生等的教学工作，并承担住院医师、专科医师及全科医师规范化培养等多项教学任务。全科医生住院医师规范化培训楼2017年底建成并于2018年4月投入使用。医院已初步实现信息化建设管理。

医院设有门诊部、急诊科、痿病科、康复科、肾病科、肺病科、针灸科、推拿科、儿科、妇产科、肛肠科、眼耳鼻喉科、骨伤一科、骨伤二科、外科、重症医学科、麻醉科、口腔科、治未病科、心病科、脑病科、风湿皮肤科等22个临床科室和医学影像科、超声医学科、营养科、制剂科、医学检验科、输血科、病理科、消毒供应室、药学部等9个医技医辅科室。其中，肛肠科为国家“十二五”中医重点专科建设单位和云南省中医重点专科；骨伤科、康复科、肾病科为云南省中医重点专科，痿病科、妇产科、肺病科、针灸科为文山州中医重点专科。

我院注重学科建设和技术创新，大力引进和开展新技术、新项目，先后引进并熟练开展了腹腔镜、鼻内镜、硬性软性输尿管肾镜、关节镜等微创诊疗技术，以及镜下肿瘤注射化疗、骨密度测定等新技术和冬病夏治夏病冬治“三伏三九天炙”、“热敏灸”、督脉灸、平衡罐、调泌疗法等中医特色治疗项目共90项。在坚持中医特色兴院的同时，医院大力引进现代化高精尖医疗设备，相继配置了磁共振成像系统、医用射线专用检测仪器多功能全数字化X线摄影系统、螺旋CT、移动式C臂、超声诊断仪、实时四维彩色多普勒超声诊断仪、大型生化仪以及配套齐全的检验设备和病理检验设备、手术室层流净化系统、中心供氧系统、电动手术台、BIODEX多关节等速测试与康复系统、眼科光学相干断层扫描仪、软性输尿管肾镜、电子鼻咽喉镜、关节镜等设备，为医院的健康持续发展奠定了良好的基础。

医院始终坚持“创大医博爱医院，做仁心仁术医生”的发展战略，坚持“中医为本，兼容中西，发展专科，追求卓越”的宗旨，奉行“勤思致远，笃行至善”的院训，坚持中医为主的办院方向，坚持把突出社会效益、维护群众利益、构建和谐医患关系放在第一位，奉献大爱，造福七乡儿女，先后获得“全国医院文化建设先进单位”“云南省卫生系统行业作风先进单位”“云南省中医药先进集体”“云南省三八红旗集体”等20余项荣誉称号。